Lista aportowanych nieruchomości została wspólnie uzgodniona przez Przewozy Regionalne i PKP SA. Przekazanie nieruchomości jest uzależnione teraz od zgody Zgromadzenia Wspólników Przewozów Regionalnych. Przekazywane obiekty to grunty, zaplecza techniczne, pomieszczenia administracyjne w trzynastu województwach. Wśród nich, dwa największe kompleksy to: hale naprawcze i zaplecza techniczne w Idzikowicach (województwo łódzkie) o wartości 20 mln złotych oraz we Wrocławiu o wartości 28 milionów złotych. Grunty i budynki wnoszone do innych spółek muszą mieć tzw. zdolność aportową. Aby PKP SA mogła je przekazać muszą one zostać: uwłaszczone na rzecz PKP SA, wydzielone z terenów zamkniętych, naniesione na mapy geodezyjne oraz oszacowane przez niezależnych rzeczoznawców. Proces przygotowania jednej nieruchomości do aportu trwa od pół do półtora roku. Polskie Koleje Państwowe SA, zgodnie z ustawą o restrukturyzacji i komercjalizacji PKP, wnoszą do obecnych i byłych spółek Grupy PKP niezbędny dla ich funkcjonowania majątek. Nieruchomości wniesione przez PKP SA do spółek kolejowych mają wartość 6 miliardów złotych. W tym roku PKP SA, poza aportem do Przewozów Regionalnych, wniesie nieruchomości o wartości ponad 400 milionów złotych między innymi do spółek: PKP CARGO SA, PKP Energetyka SA, Telekomunikacja Kolejowa Sp. z o.o., Przedsiębiorstwa Napraw Infrastruktury Sp. z o.o. Łącznie w 2010 roku PKP SA wniesie do spółek nieruchomości o wartości około 700 milionów złotych. Przekazanie nieruchomości samorządowej spółce Przewozy Regionalne umożliwiła nowelizacja ustawy o Funduszu Kolejowym oraz ustawy o komercjalizacji, restrukturyzacji i prywatyzacji przedsiębiorstwa państwowego „Polskie Koleje Państwowe”. Nowelizacja ustawy umożliwia PKP SA wniesienie do Spółki Przewozy Regionalne Sp. z o.o. aportu w postaci nieruchomości niezbędnych do prowadzenia działalności w zakresie kolejowych przewozów pasażerskich, odkupienie udziałów objętych przez PKP SA z tego tytułu przez skarb państwa oraz nieodpłatne przekazanie udziałów przez skarb państwa na rzecz samorządów województw.